一、睾丸疾患
具有睾丸下降不良(即睾丸未正常下降到阴囊)病史的人，无精子症发生率显著升高，双侧睾丸下降不良者的无精子症发生率比单侧的高2倍。这类患者即使有精子，精液质量也异常，尤其是少精子率显著升高。
睾丸损伤，这里仅记录了那些伴有阴囊血肿或血尿，说明有睾丸或生殖泌尿道损伤的不育患者的情况。这类病人的无精子症或精液异常发生率显著增加。
具有睾丸扭转病史的人很少，但常并发无精子症和少精子症。
曾由非腮腺炎引起的睾丸炎和附睾炎的病人，其精子密度和活动率显著降低。这类病人的睾丸体积较小，附性腺炎症的发生率也较高。
二、泌尿生殖道疾病
在整个人群中，患有性传播性疾病与未患此病者的无精子症发生率相似，但是前者精液分析异常的发生率显著高于后者。性传播疾病似乎不影响精子密度，说明不会引起输精管道狭窄或堵塞。性传播性疾病患者一般表现在精子活动率下降，这与附性腺功能的紊乱，特别是与附睾炎有关。
泌尿生殖系统炎症常伴有尿道症状，尿道症状包括尿痛、尿频、尿急、血尿和排尿困难等。这些病人精液质量常常异常，特别是精子形态和活动率较低。有泌尿系统症状的患者中，有27%的人前列腺液化验结果异常，或者精液细菌学，或生物化学检查异常，说明其中一部分人患有附性腺炎症。
三、其他系统疾病
青春期前后发生腮腺炎可引起无精子症的发生率增高，并可伴有较高的异常精液的可能性。青春期后发病者，精子密度明显低于未发病或青春期前发病者。腮腺炎病人中仅有4。4%的人合并有睾丸炎，多发生于青春期后。睾丸炎，尤其是双侧睾丸炎显著影响精液质量，可造成无精子症。无论是单侧或双侧睾丸炎，精液异常者均增加。总之，腮腺炎合并睾丸炎时，对生育会产生不良影响。
支气管炎特别是支气管扩张常常是累及全身的纤毛功能紊乱的临床表现。这类病人中，无精子症发生率显著增高。所有这种病人的睾丸质地、体积及活检所见均正常，说明无精子症是由于输精管道堵塞引起的。气管炎患者的精液分析异常率增高，精子平均密度和向前运动的精子比例较低。
糖尿病与射精功能障碍相关，并不引起无精子症或者精液质量异常，所以糖尿病对生育的影响是通过性功能紊乱而造成的。