生理功能障碍是指不能进行正常的性行为或不能达到正常的高潮的生理功能障碍。主要是心理和生理，心理因素是主要原因造成的疾病。生理功能障碍通常表现为性欲减退。该病表现为性行为，阴茎勃起，性交，高潮和射精等。引起生理功能障碍的原因大致可以分成三类：生物，心理和文化因素。
引起男人生理功能障碍的主要原因：
个人因素：最常见的是焦虑，例如怕自己的性能力不足以满足对方要求，怕怀孕，怕性行为被人发觉，怕被认为淫荡等。
双方关系：例如对对方过分尊重，恐惧，厌恶，双方缺乏感情或缺乏交流等。
不正确的知识：例如认为性行为应随停经而终止，到了一定年龄就不会有性能力，患某些疾病影响性行为等。过去认为手淫可引起性生理功能障碍，其实这是一种误解，手淫一般只引起睡眠不足，影响次日的精力，不引起特定的疾病。过度手淫则对身体会产生影响。
社会文化背景因素：科学的性知识过去研究得很少，传布更不广，因此人们关于性的知识往往是道听途说而来，一般都认为谈论性问题是“下流”的，因此即使夫妻之间，也不一定有充分的交流，不知道什么样是适当的性行为，有了问题也不敢寻求帮助。
其他疾病：某些疾病或某些药物确实可以影响性能力，特别是影响男性的勃起。性病或短期用药虽常可影响性功能，但人们通常没有引起注意。慢性疾病因为时间长，所以引起注意，其他疾病引起的性功能障碍只占少数，有一些还是因为焦虑引起的，例如怕进行性交加重疾。
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