性交困难的原因有男方与女方两个方面。
男方常见的原因有：
1.性功能障碍。如患阳痿，阴茎不能勃起或阴茎勃起不坚，阴茎不能插入阴道;又如早泄，由于射精过快，可于阴道外射精，射精后阴茎即疲软，招致阴茎不能插入阴道。
2.生殖器畸形。如两性畸形，阴茎过于短小，阴茎无法与妇方交接。
3.不懂性知识。男方对女性生殖器构造及性交基本知识一无所知，性交时动作笨拙，方向不明，不知所措，停留在外阴部盲目撞击，性器未曾交合。
妇方常见的原因有：
1.性功能障碍。如女方在性交时由于恐惧，焦虑，紧张等心理原因造成阴道痉挛，两腿并拢，阴道口紧缩，造成男方无法将阴茎插入阴道。
2.生殖器畸形。例如女方患处女膜闭锁，先天性无阴道或两性畸形患者，由于无阴道，也无法与丈夫交接。
3.生殖器损伤疾病。如女性分娩时造成产道损伤及感染，产后阴道炎症形成瘢痕继而使阴道粘连狭窄，性交时造成性交障碍。又如分娩时会裂伤，若缝合过高过紧，个别情况下也可造成性交困难。
4.外阴疾患。例如外阴巨大橡皮肿，阴道口被橡皮肿遮盖，阻挡前进去路，使阴茎无法插入阴道。前庭大腺囊肿，如体积较大，也可造成性交困难。
防治性交困难的方法有：
1.加强婚前检查。婚前检查时，一旦发现妇方有生殖器畸形，婚前可住院加以矫治，在新婚之夜夫妻可享有圆满的性生活。
2.心理治疗。对女方属敏感的神经类型者，或小时受过不正当性教育，或过去有受过性强暴病史者，特别要注意心理疏导，使之解除顾虑，消除紧张，焦虑及恐惧的情绪，在性爱中精神方松安然交接，真正享受到性爱的愉悦。
3.寻求咨询。夫妇生活中，一旦发生性交困难，要及时到性学咨询门诊咨询，请求医生帮助分析性交困难的原因，从而针对处理。
4.手术治疗。对一些确因器质病变造成性交障碍者，如阴道瘢痕狭窄，外阴巨大橡皮肿，处女膜闭锁，先天性无阴道等，可进行手术治疗。