阴蒂疾患、阴蒂的异常很大程度是由于性生活中不注意所导致，但实际上在卫生保健工作中却又常常被忽略。另外，能够影响身体其它器官的所有病理过程，也同样能够影响阴蒂。因此，感染、肿瘤、炎症、瘢痕、萎缩等病变在这个特殊的器官都是可能存在的。这里我们讲讲阴蒂疾患与性生活的关系，一些主要阴蒂疾患、阴蒂的异常常识。
阴蒂肥大，可能是对长期过量雄激素刺激的反应。经常手淫的妇女更容易引发发生阴蒂肥大，这与反复长时间对阴蒂的直接机械刺激有关。一般能够通过检查外生殖器确定有无手淫，临床经常可以遇到由手淫导致阴蒂明显肥大的病例，都有反复的长时间的自我刺激。
了阴蒂粘连和阴蒂包皮过长的问题，这可能是影响女性性反应的一个原因。这种病症在普通人群中很常见，阴蒂的敏感性以及由此而产生的女性性兴奋可以由于阴蒂包皮的切除而增强。但是根据迄今发表的资料，还没有任何严谨的研究能够证实这一点。有些妇女把阴蒂的环形切开术看为一种对于女性性行为具有奇迹般效果的方法，怀着将能体验一种奴形式的性反应和领受新的性感的期望要求做这样的手术。
阴蒂疼痛可以在很多情况下发生，但未必都能够准确地说出感到不适的部位。感染是阴蒂疼痛最常见的原因，但感染的发病学和表现类型却可以有很大的不同。有时候，阴蒂本身有孤立散在的病变，例如泡疹性外阴炎：有时候则是核整个外阴的炎症所波及（如霉菌感染的病人）。局部刺溢可能是阴蒂疼痛的第二位原因，有时候可以伴有继发性感染而使疼痛加重。刺激也可与件行为有关（如搔抓阴蒂成器具刺激，也可能与其他因素有关，包括过紧的内裤的擦伤或者化学刺激，如肥皂、香料、洗涤剂等。神经炎有时可以影响阴蒂，引起持续性或间歇性疼痛，这种情况在糖尿病妇女中景容易见到，小剂量的酚噻嗪可能有某种程度的缓解作用。
有些妇女主诉只是在高度性兴奋时才伴有阴蒂的触痛。这些妇女可能根本没有病理情况，她的反应事实上是一种非常正常的反应。在女性性反应周期的高峰期，阴蒂头对于直接的刺激特别地敏感。而且，因为阴蒂或阴蒂的邻近区没有相应的润滑功能，所以用手刺激阴蒂可以引起疼痛，除非阴道润滑作用影响到了阴蒂区。另一个与临床有关的情况是常常有许多男子粗重而持久地刺激阴蒂，使得女方感到不适，而病人就医时却误认为是自已的问题。